(https://www.nature.com/articles/s41586-025-09316-0)
耶魯大學兩位博士生前往康乃狄克州的一片研究森林,研究 15 種常見樹種,包括橡樹、楓樹和松樹。他們從 158 棵樹的樹幹上取下木材樣本,方法是取比鉛筆還細的芯。他們還從每棵樹周圍採集了土壤樣本。從木材和土壤中提取 DNA 後,他們把遺傳物質送到實驗室對 16s 和ITS這兩個關鍵標記基因進行定序。
正如不同的動物根據其食物擁有各自獨特的微生物群落一樣,這15種樹種的木材中也生活著獨特的菌叢。例如,楓樹中含有更多專門食用糖分的菌群,它們可能以楓糖漿的甜汁為食。同時,已知抗腐爛的樹種,例如東部鐵杉,其微生物豐度最低。整個森林也呈現出一種普遍的模式。無論樹種如何,微生物群落似乎都專注於不同組織中的生存。例如,密集的心材往往比周圍的邊材含氧量更低,因此擁有更豐富的甲烷菌,這些菌會產生甲烷。相較之下,邊材中的細菌則適應於在高氧濃度的環境中生存。
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