豬隻遷徙的基因組學和形態學證據

 (https://www.science.org/doi/10.1126/science.adv4963)

 人類長期以來一直將動物物種遷移到其原生範圍之外，劇烈地改變了生態系統，尤其是在島嶼上。脊椎動物向東跨越華萊士線進入華萊士區（位於亞洲和澳洲生物群落之間的生物地理區域）的遷徙，對環境產生了重大影響。例如，雖然豬屬（ Sus）的自然分佈範圍主要位於歐亞大陸和印尼西部，但如今野豬已廣泛分佈於華萊士區。

人類活動將豬種引入華萊士線以東地區，很可能始於4000多年前的新石器時代之前，當時蘇拉威西島的本土物種蘇拉威西豬（S. celebensis ）被引入。現代家豬的祖先－歐洲野豬（ S. scrofa）也可能在4000至3000年前，隨著南島語係人群從東亞大陸和台灣，經菲律賓和華萊士北部地區向美拉尼西亞和玻里尼西亞擴張，被引入華萊士線以東地區。然而，這些來自華萊士和大洋洲的豬群的地理起源和祖先仍然未知。

為了確定華萊士、美拉尼西亞、密克羅尼西亞和玻里尼西亞的豬群的地理起源，以及它們與人類一起遷徙的潛在擴散路線，這篇論文對 119 個豬屬核基因組（包括 63 個歷史和古代基因組）進行了測序，並從 401 個現代個體核內和 307 個考古個體測量數據中生成了第三個臼齒）。

基於祖源反捲積的祖源分析（該分析利用局部祖源推論來識別和分離混血個體中的特定祖源）揭示了華萊士地區豬的多次擴散過程。最初的擴散是東南亞島嶼特有豬種（爪哇豬，學名：S. verrucosus）從爪哇島自然遷徙至如今的巴厘島，這個過程可能與人類活動有關。蘇拉威西島的本土豬種（蘇拉威西豬，學名：S. celebensis）隨後透過水路擴散至小巽他群島，包括弗洛勒斯島和帝汶島，這可能是4000多年前狩獵採集者遷徙的結果。

近代，大約在3500至3000年前，來自中國南方和菲律賓的家豬（學名：Scrofa）被引入瓦拉西亞和大洋洲的大部分島嶼。這些引入的豬後來在該地區的許多島嶼上變成了野生豬。最後，在殖民時期，具有歐洲血統的豬被廣泛引入該地區，包括小巽他群島和巴布亞紐幾內亞。