與狼的基因糾纏塑造了現代犬類

 (https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2421768122)

 狗起源於晚更新世時期人類與灰狼的互動，此後便在人類社會中廣泛存在。狼向狗的基因滲入較為罕見，但適應性基因滲入已被證實與高海拔存活率有關。然而，任何廣泛的基因交流在全基因組統計評估中均低於檢測閾值。為了重新檢驗狗與狼之間基因交流的證據，這篇論文分析了2693個已發表的狗和狼基因組，並結合了高靈敏度的局部祖源推論和對核基因、線粒體基因組及Y染色體序列的系統發育基因組學分析。儘管狗和狼在核基因層面上表現出明顯的遺傳分離，但沒有一個核基因樹支持狗的單系性。單親遺傳標記顯示狗和狼的混合且交錯的進化枝，且具有較強的支持率和不一致的系統發育拓撲結構。利用局部祖源推斷，論文發現：64.1%的現代犬種攜帶狼的祖先基因，這些基因混合平均發生在近千代以前，如今已覆蓋其個體核基因組的約0.14%。在現代野生鄉村犬（n = 280）中，100%的分析基因組都帶有狼的祖先基因。犬種的狼祖先基因與體型、品種類別和性格特徵等功能性狀有關。在鄉村犬中，狼祖先基因在嗅覺受體基因中富集，這表明為了提高感覺敏銳度而進行的適應性基因滲入可能幫助這些野生犬在更具挑戰性的環境中生存下來。總而言之，犬狼混合很可能是塑造現代犬演化過程中的重要因素。