鳥類演化關係的新系統

 (https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2409658122)

 這篇論文建構了一幅完整的、按時間尺度劃分的世界鳥類進化樹。此演化樹整合了1990年至2024年間發表的262項研究中9,239個物種的系統發育估計值，並採用了Open Tree合成演算法。其餘物種則根據經過整理的分類資訊被納入樹中。這棵完整進化樹的末端節點與eBird和其他資源使用的克萊門茨分類法中的物種相對應，並與其他分類系統進行了交叉映射，包括生命之樹（Open Tree）、美國國家生物技術資訊中心（NCBI）和全球生物多樣性資訊機構（GBIF）。在我們應用的不同分類版本（v2021、v2022和v2023）中，已命名鳥類物種的總數在10824至11017之間。論文分享了每個分類版本的完整進化樹。用於產生這棵樹的程式、軟體和資料儲存均已公開且可重現。論文展示的系統發育樹基於Aves 1.3版本，可隨著新系統發育資訊的發布輕鬆更新。透過將地理數據與系統發育樹關聯起來，計算全球鳥類的區域系統發育多樣性，從而展示了該數據資源所支持的大規模分析類型。