植物標本館的收藏可以用來重建數十萬個族群

(https://academic.oup.com/bioscience/advance-article/doi/10.1093/biosci/biag048/8670227?login=false)

 在過去的五百年裡,人類累積了數億份植物標本,這些標本正日益被認為是不可替代的生物多樣性資料來源。此類標本已被用於鑑定新物種、解析地理分佈的轉移或隱蔽性)和生物相互作用,以及各個方面生物變化的分析例如物候。如今,得益於新型DNA萃取、定序和生物資訊工作流程的發展,也可以取得這些標本館藏的遺傳資料。

這篇論文在前人研究和概念驗證的基礎上,首次對植物標本館藏品提供群體水平遺傳數據以監測地球維管植物遺傳育種值的能力進行了定量評估。首先正式確定了植物標本館藏品對標準化遺傳監測的貢獻要求,這些要求基於物種功能性狀,並採用生物學保守的群體界限。接下來,將全球生物多樣性資訊機構(GBIF)中超過5100萬份數位化植物標本轉化為空間和時間上可區分的標本群體,這些群體可以進行測序,從而提供量化遺傳育種值所需的群體水平遺傳數據。鑑於大多數植物標本館藏品仍未數位化,論文也評估了標本數位化在利用植物標本館藏品進行遺傳監測方面的潛在益處。最後,論文探討了調動這些海量保存的遺傳資料的潛在意義,包括這些資料如何促進生態和演化研究及保護,對植物標本館、研究人員、政策制定者和公眾的潛在影響,以及將植物標本館藏品應用於遺傳監測的重要考量、局限性和最佳實踐。



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